小惑星表面や、衝突装置の爆発で作った人工クレーターに、はやぶさ２が着地して石や砂を採取する目玉ミッション。表面には２回、クレーターには１回着地する。

　イオンに電圧をかけて噴射する主力エンジン。息をフーッと音が聞こえるか聞こえないかの強さで吹いた程度の力だが燃費が良く、長距離航行用とされる。１号機より推進力が２５％高まった。４台搭載し、最大で３台同時に運転する。

　太陽光を電力に変換し、搭載機器へ供給する。３パネル２翼構成で、展開すると６メートル×４．２メートル。

　採取した小惑星サンプルを地球へ持ち帰るためのカプセル。秒速１２キロメートルで大気に突入、位置を知らせる電波を発しながら、パラシュートを開いて着地する。着陸場所はオーストラリアの砂漠を予定。はやぶさ２自身は地球へは着陸しない。

　小惑星に人工クレーターを作るための装置。中に詰められた爆薬で銅板をぶつけてクレーターを作る。クレーターの内部を調べることで、宇宙空間の影響を受けていない新鮮なサンプルを採取できる。はやぶさ２で初めて搭載された。

　小惑星表面からサンプルを採取する装置。筒状のホーン内部で小さな弾丸を撃ち、巻き上がった砂などを採取する。

　小惑星着陸前に目印として表面に降ろす。直径約１０センチで、弾みすぎないように容器の中に小さな粒がたくさん入っている「お手玉」構造。５個搭載。１号機の３個から増えた。

　地上局と通信したり、観測データを地球に送ったりする。通信速度は１号機より向上したが、地上に比べると格段に遅い。

　はやぶさ２の向きを知るために恒星の位置を観測する機器。この情報をもとに姿勢を制御する。

　小惑星の表面を探査するロボット。３個搭載。会津大や東京理科大などが製作した。１号機に搭載したものの後継機。

　ドイツとフランスが協力して製作した約１０キロの小型着陸機。単独で小惑星表面を観測したり、はやぶさ２のサンプル採取の案内役を務めたりする。１度だけジャンプして移動が可能。