２００４年６月１日、長崎県佐世保市立小学校で、６年生の女児（当時１１）が同級生の女児（同１２）の首にカッターナイフで切りつけて殺害した。長崎家裁佐世保支部が同年９月の最終審判で、加害女児は、被害者が交換ノートやインターネットに掲載した文章を自分の「居場所」への侵入ととらえて怒りを募らせ、計画的に被害者の命を奪ったと認定した。

人口約２６万人の佐世保市には米海軍、海上自衛隊、陸上自衛隊が基地を置く。市によると、米軍人・軍属・家族は計約５８００人、自衛隊員は約５９００人。佐世保港一帯には艦船が停泊する岸壁や弾薬庫などの施設がある。基地の経済効果は年間約１２００億円とされる。