専門医は学会ごとに資格認定の要件を定め、一定の症例経験や専門研修の修了のほか、試験合格などの条件を満たせば資格が与えられ、学会認定医として広告できる。２０１８年度から第三者機関「日本専門医機構」が認定する仕組みに変わる。

２０１８年度から導入された制度。国家試験に合格後、２年間の初期臨床研修を終えた医師が、内科や外科など１９の基本診療科から専門領域を選び、３年程度で複数の病院を回りながら知識や技術を現場で学ぶ。その後、第三者機関の日本専門医機構から専門医の認定を受ける。

特定の臓器や疾患に限定せず幅広い視野で診る。地域ニーズに的確に対応できる「地域を診る医師」として、他の領域別専門医や他職種と連携して、多様な医療サービスを包括的かつ柔軟に提供することが期待されている。（厚生労働省の「専門医の在り方に関する検討会」報告書より）