市長発議で２００６年３月１２日実施。投票率５８．６８％。反対４万３４３３票（８７．４％）、賛成５３６９票（１０．８％）、無効８７９票（１．８％）。米軍再編をめぐり市長と市議会が対立する中、政争の具として使われたとの指摘もあった。

在日米軍再編の一環で、厚木に駐留する空母艦載機５９機の部隊を１４年までに岩国に移す。併せて普天間の空中給油機１２機も岩国に移す。岩国からグアムに移るヘリコプター部隊などを差し引いても、岩国の米軍機数は現在の倍の約１２０機に膨らみ、嘉手納と並ぶ極東最大級の航空基地となる。合併前の旧岩国市で０６年に行われた住民投票では、艦載機移転反対が８７％という結果が出たが、合併後の０８年２月の市長選では移転容認派の福田良彦市長が初当選した。

昨年１０月、岩国市が国に提案した４３項目の安全安心対策の１項目として、「国と市の定期的な協議の場の設置」を要望していた。協議機関の設置は、米空母艦載機移転に反対していた井原勝介前市長も防衛省に求めたが、実現しなかった。他の地域では沖縄県の普天間飛行場の移設問題を話し合う政府と同県や地元自治体の協議会がある。