ウランをプルトニウムに変え、燃料を増やす原子炉。福井県敦賀市にあり、１９９５年にナトリウム漏れ事故を起こした。現在は停止中。開発には１兆円以上がつぎ込まれたが、実用化のめどは立っていない。

原子炉内の核分裂を抑えたり進めたりする役割を果たすのが、燃料の間を抜き差しする制御棒だ。高速増殖原型炉もんじゅの場合、制御棒は長さ約４・４メートルのステンレス製で計１９本。この制御棒を抜けば、原子炉の運転が始まる。ただ、もんじゅの原子炉は１４年余りも動かしておらず、制御棒を動かした影響で核分裂がどの程度進むのか、正確には分からない。このため、今後約２週間は通常運転（定格出力２８万キロワット）の０・０３％程度という低い出力を保ちながら、制御棒の利き具合を確かめるという。